尽管与传统注塑加工出来的模具相比，模内热切模具有许多显著的优点，但模具用户亦需要了解模内热切模具的缺点。

1. 模具成本上升

模内热切元件价格比较贵，模内热切模具成本会大幅度增加。如产品附加值较低，产品产量不高，对于注塑加工厂商来说经济上不划算。对许多发展中国家的模具用户，模内热切系统价格贵是影响模内热切模具广泛应用的主要问题之一。

2. 在注塑加工模内热切模具制作工艺设备要求高

模内热切模具需要精密加工机械作保障。模内热切系统与模具的集成与配合要求非常严格，否则模具在生产过程中会出现很多严重问题。 如模具油缸安装孔平面加工粗糙密封件无法封油导致油缸无法运动，切刀与模仁的配合不好导致切刀卡死无法生产等。

3. 操作维修比较复杂

与模内热切模具相比，模内热切模具操作维修比较复杂。如使用操作不当易损坏模内热切零件，使生产无法进行，造成巨大经济损失。对于模内热切模具的新用户，需要较长时间来积累使用经验。